CBMA

My current research interests focus essencially in the study of pathogenic yeasts and in the understanding of their relation with the human host.

The overall objectives are the developement of new molecular tools for the diagnosis and genotyping of these pathogenic agents, as well as the study of specific genes involved in the virulence mechanisms of these microorganisms.  

OLIVEIRA M, SAMPAIO P, SABINO R, VERISSIMO C, ZANCOPÉ-OLIVEIRA R. PAIS C, 2014. First autochthone case of sporotrichosis by Sporothrix globosa in Portugal. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease (accepted).

DELGADO-SILVA Y, NOGUEIRA E, VAZ C, CARNEIRO C, PEREIRA J, CORREIA A, CARRETO L, SILVA S, FAUSTINO, A, PAIS C, OLIVEIRA R, SAMPAIO P. 2014. Participation of Candida albicans transcription factor RLM1 in cell wall biogenesis and virulence. PLoS One (accepted).

SABINO R, SAMPAIO P, CARNEIRO C, ROSADO L, AND PAIS C. 2011. Isolates from hospital environments - are the most virulent of the Candida parapsilosis complex. BMC Microbiology 2011, 11:180 doi:10.1186/1471-218011-180.

VAZ C, SAMPAIO P, CLEMONS KV, HUANG Y-C, STEVENS DA, AND PAIS C. 2011. Microsatellite multilocus genotyping clarifies the relationship of Candida parapsilosis strains involved in a neonatal intensive care unit outbreak. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. doi:10.1016/j.diagmicrobio.2011.07.002.

SANTOS C, LIMA N, SAMPAIO P, AND PAIS C. 2011. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight intact cell mass spectrometry (MALDI-TOF-ICMS) to detect emerging pathogenic Candida species. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. doi:10.1016 jdiagmicrobio.2011.07.002.

CORREIA A, LERMANN U, TEIXEIRA L, CERCA F, BOTELHO S, GIL DA COSTA RM, SAMPAIO P, GARTNER F, MORSCHHAEUSER J, VILANOVA M, AND PAIS C. 2010. Limited role of secreted aspartyl proteinase Sap 1-6 in Candida albicans virulence and host immune response in murine hematogenously disseminated candidiasis Infect Immun 78:4839-4849.

SAMPAIO P, SANTOS M, CORREIA A, AMARAL F E., CHAVÉZ-GALARZA J., CASTRO AG, PEDROSA J, PAIS C. 2010. Virulence decrease of Candida albicans variants of the same strain isolated from an immunocompromised patient with recurrent blood stream infection. . PLoS One.  5(4): e10155.

SABINO R, SAMPAIO P, ROSADO L, GRAÇA M, STEVENS D, AND PAIS C. 2010. New microsatellite markers for molecular genotyping of Candida parapsilosis sensu stricto. Journal of Clinical Microbiology, 48:1677-1682.

SABINO R, VERISSIMO C, BRANDAO J, ALVES C, PARADA H, ROSADO L, PAIXAO E, VIDEIRA Z, TENDEIRO T, SAMPAIO P, PAIS C. 2010. Epidemiology of candidemia in oncology patients: a 6-year survey in a Portuguese central hospital. Medical Mycology 5:1-10.

SAMPAIO P, NOGUEIRA E., SÁ LOUREIRO A., DELGADO-SILVA Y., CORREIA A. AND PAIS C. 2009. Increased number of glutamine repeats in the C- terminal of Candida albicans Rlm1p enhances the resistance to stress agents. Antonie van Leeuwenhoek. 96:395-404.

AMARAL C, LUCAS M, COUTINHO J, CRESPÍ AL, ANJOS MR, and PAIS C. 2008. Microbiological and Physicochemical Characterization of Olive Mill Wastewaters from a Continuous Olive Mill in Northeastern Portugal. Bioresource Technology 99: 7215-7223.

CORREIA A., SAMPAIO P., JAMES S. and PAIS C. 2006. Candida bracarensis sp. nov. a novel anamorphic yeast species phenotypically similar to Candida glabrata. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56:313-317.

SAMPAIO P., GUSMÃO L., CORREIA, A., ALVES C., RODRIGUES, A. G., PINA-VAZ C, AMORIM A. and PAIS C. 2005. New microsatellite multiplex PCR for Candida albicans strain typing reveals microevolutionary changes. Journal of Clinical Microbiology 43: 3869-3875.

CORREIA A, SAMPAIO P, ALMEIDA J and PAIS C. 2004. Identification of Candida clinical isolates by PCR fingerprinting: a contribution to the study of molecular epidemiology of candidiasis in Portugal. Journal of Clinical Microbiology  42: 5899-5903.

DUARTE FL, PAIS C, SPENCER-MARTINS I and LEÃO C. 2004. Isoenzyme patterns: a valuable molecular tool for the differentiation of Zygosaccharomyces species and detection of misidentified isolates. Systematic and Applied Microbiology 27: 436-442.

SAMPAIO P., GUSMÃO L., ALVES C., PINA-VAZ C, AMORIM A. and PAIS C. 2003. Highly polymorphic microsatellite for identification of Candida albicans strains. Journal of Clinical Microbiology 41:552-557.

SAMPAIO, J.P., GADANHO, M., SANTOS S., DUARTE, F. L., PAIS, C., FONSECA, A. and FELL, J.W. 2000. Polyphasic taxonomy of the genus Rhodosporidium: R. kratochvilovae and related anamorphic species. International Journal of Systematic Bacteriology 51:687-697.

DUARTE F, C. PAIS, I. SPENCER-MARTINS, C. LEÃO. 1999. Distinctive electrophoretic isoenzyme profiles in Saccharomyces sensu strictu . International Journal of Systematic Bacteriology 49:1907-1913.

ALMEIDA, MJ. C. PAIS. 1996. Characterization of the yeast population from traditional corn and rye bread doughs. Letters in Applied Microbiology 23: 154-158.

ALMEIDA, M.J., C. PAIS. 1996. Leavening ability and freeze tolerance of yeasts isolated from traditional corn and rye bread doughs. Applied and Environmental Microbiology 62: 4401-4404.

Cetaceans as marine ecosystem health sentinels – CETSENSI (RECI/AAG-GLO/0470/2012).  FCT financed project. Coordination: Catarina Eira, Universidade de Aveiro. Coordinator at the Universidade do Minho.

Biotransformation of by-products from fruit and vegetable processing industry into valuable bioproducts – TRANSBIO (Grant agreement no: 289603).Financed in the scope of  the 7th framework programme EU, started on December  2011. Includes 16 participants, including laboratories, research centres and companies, from Spain, Portugal, Germany, Belgium, Italy, Romania, Argentina, Costa Rica and Mexico. Coordination: Thomas Dietrich from Fundacion Tecnalia Research & Innovation, Spain. Principal investigator of the portuguese team. 

Mechanisms of Candida glabrata biofilms tolerance to antifungal agents (PTDC/SAU-MIC/119069/2010). Projeto financiado pela FCT, com início em 2012. Coordenação de Mariana Rangel Henriques, Universidade do Minho. Integra a equipa de investigação.

Red iberolatinoamericana de diagnóstico molecular de las micosis sistémicas y oportunistas (P207RT0353). Coordenadora da equipa portuguesa. Projeto financiado pelo Programa Iberoamericano de Ciência e Tecnologia para o Desenvolvimento (CYTED), de 2008 a 2011. Desta rede internacional fazem parte o Centro de Salud Carlos III, Madrid; Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro; Universidade Autónoma do México, Cidade do México; ANLIS Departamento Micología Dr. Carlos G. Malbrán, Buenos Aires; Centro de Investigaciones Biologícas, Medellín, Colômbia.

 International post-graduated training programme – advanced interdisciplinary courses (Processo 117126). Projeto financiado pela Fundação Calouste Gulbenkian, de Maio de 2011 a Maio de 2012, no âmbito do programa de apoio a atividades de reforço da capacidade científica. Coordenadora do projeto.

Implementation of a nacional facility for DNA microarrays: phase II” (PTDC/BIA-BCM/64745/2006). Projeto financiado pela FCT de 2009 a 2012. Coordenação do Professor Manuel Santos da Universidade de Aveiro. Integrou a equipa de investigação.

Molecular epidemiology, risk factors and prognosis of Candida parapsilosis bloodstream infections in oncological patients. Investigadora responsável. Projeto que decorreu de 2008 a 2010, financiado pelo Centro de Biologia Molecular e Ambiental (CBMA) e verbas internas da Universidade do Minho, em colaboração com o Instituto Nacional de Saúde Dr. Ricardo Jorge (INSARJ) e o Instituto Português de Oncologia de Lisboa.

Immunobiological studies of Candida albicans secreted aspartyl proteinases and their use as target antigens for vaccination against systemic candidiasis – SapAlbicans (POCI/SAU-IMI/58014/2004). Investigadora responsável. Projeto financiado pela FCT de 2005 a 2008 e desenvolvido em colaboração com o Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar (ICBAS) da Universidade do Porto e com o Centro de Neurociências e Biologia Celular da Universidade de Coimbra.

FreezYeast. Projeto aprovado no âmbito do Concurso de Ideias de Negócio FIVE promovido pelo IAPMEI em colaboração com a AdI, 2005 e financiado posteriormente pelo Programa NEOTEC da AdI, 2006. Integrou a equipa promotora do projeto.

FWScience 2004 – The fascinating world of science (SAS6-CT-2003-509052). Responsável pela coordenação e desenvolvimento na Escola de Ciências (ECUM). Projeto financiado pela União Europeia no âmbito do 6º Programa Quadro, call FP6-science and society-2, European Science and Technology Week 2004.

Molecular epidemiology of candidosis using microsatellite DNA polymorphisms as a basis for a typing system.Investigadora responsável. O projeto decorreu entre 2002 e 2005 com a colaboração do Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto (IPATIMUP) e do Hospital de S. João, Porto e foi financiado pelo Centro de Biologia (FCT) e verbas e internas da Universidade do Minho.

Investigation of the relationships between basidiomycetous yeasts and filamentous heterobasidiomycetes: a polyphasic approach (PCNA/C/BIA/174/96). Projeto financiado pelo Programa Praxis XXI – Medida 2, entre 1997 e 2000. Responsável pela tarefa respeitante à Análise de polimorfismos isoenzimáticos. O projeto foi coordenado pelo Professor João Paulo Sampaio da Secção Autónoma de Biotecnologia da Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa.

Isolamento e caracterização de leveduras: aplicações em enologia.Projeto financiado pelo INIA no âmbito do Programa PAMAF, de 1996 a 1999. Este projeto contou com a participação da Escola Superior de Biotecnologia do Porto, Instituto do Vinho do Porto, Direcção Regional de Agricultura de Entre-Douro e Minho (D.R.A.E.D.M.) e Direcção Regional de Agricultura de Trás-os-Montes (D.R.A.T.M.) e foi coordenado pela Professora Cecília Leão, Universidade do Minho.

Desenvolvimento e aplicação de métodos de biologia molecular para uma rápida caracterização de diferentes variedades de Zea mays L. Investigadora principal. Projeto integrado no projeto global sobre Colheita, avaliação e utilização do germoplasma regional das espécies herbáceas da Região Norte, coordenado pela Doutora Rena Farias e financiado pelo Programa PAMAF de 1995 a 1998.

Isolamento e caracterização de leveduras de fermentos e salmouras tradicionais. Investigadora responsável. O projeto decorreu entre 1994 e 1998, em colaboração com o Instituto Gulbenkian de Ciência e foi financiado por verbas do Centro de Ciências do Ambiente (FCT) e verbas internas da Universidade do Minho.

Spoilage yeasts in food and beverages: characterization and ecology for improved diagnosis and control (CT93-0830). O projeto decorreu entre 1993 e 1996 e foi subsidiado pela União Europeia através do programa quadro "Agriculture and Agro-Industry, Including Fisheries". Para além do Departamento de Biologia da Universidade do Minho (Coordenação da Professoara Cecília Leão), participaram no projeto o Laboratório de Microbiologia do Instituto Superior de Agronomia (Coordenador), o Laboratório de Microbiologia do Instituto Gulbenkian de Ciência, o Departamento de Microbiologia da Universidade Complutense de Madrid, o Institute of Food Research, Reading, Inglaterra e o TNO, Nutrition and Food Research, Section of Molecular Biology, Holanda.